जिन लोगों को दस्त या फिर डायिरया है उन्हें मखाना नहीं खाना चाहिए. मखाने में बहुत अच्छी मात्रा में फाइबर पाया जाता हैं जिसके कारण इसे खाने से परेशानी और भी ज्यादा बढ़ जाती है.एसिडिटी की समस्या होने पर मखाने का सेवन नहीं करना चाहिए. मखाने में बहुत अच्छी मात्रा में प्रोटीन और फाइबर पाया जाता है जिसके कारण इसे खाने से गैस की समस्या हो जाती है. जिन लोगों को किडनी में स्टोन की समस्या है उन्हें मखाने का सेवन नहीं करना चाहिए. मखाने में बहुत अधिक मात्रा में कैल्शियम पाया जाता है जिसके कारण इसको खाने से किडनी में स्टोन का आकार बढ़ सकता है. इसके अलावा गर्भवती महिलाओं को भी मखाना खाने से बचना चाहिए. मखाना खाने से होने वाले बच्चे को नुकसान हो सकता है, ऐसे में जरूरी है कि आप इसे खाने से पहले एक बार डॉक्टर की सलाह जरूर लें.